Закрывать ссылки со своего сайта на чужие следует для того, чтобы не передавать вес вашей страницы другим ресурсам, на которые вы ссылаетесь.
В поисковой выдаче каждая страница сайта имеет свой вес. Чем больше сайтов на неё ссылаются, тем больше её вес в глазах поисковых систем.
Попросту говоря, если люди часто говорят о вас, значит вы интересны. Значит, выше вероятность, что вы заинтересуете пользователей Яндекса или Google. Значит, поисковая система будет показывать вас чаще. То есть у вас будет больший вес в глазах поиска. Чем чаще вас показывают, тем больше у вас читателей.
- Если ссылаются на вас — вам хорошо.
- Если ссылка с вашего сайта — вам плохо.
- Чем меньше ссылок будет на вашем сайте, тем лучше. Идеал — ни одной.
Ниже приведена схема развития реального информационного сайта.
Вертикальная линия А. Был запущен новый сайт. Все публикации сохранены. Все старые ссылки были уничтожены программным способом. Т.е. сайт был очищен.
Линия Б. Ссылочная масса опять нарастает. Поисковики выдают реже. Посещаемость падает.
Как закрыть ссылки от индексирования написано здесь.